缺点：基因工程产品的技术含量非常高，从目的基因的取得到表达载体的构建都是十分烦琐而艰巨的工作，必须在实验室中进行大量的工作。
可扩展性：基因工程技术能够实现药物生产的规模化和可持续发展。一旦建立了稳定的基因工程生产系统，可以通过扩大菌种培养或植物生长规模，快速增加药物的产量，满足市场需求。
优点是利用生物反应器尤其是微生物生产药品，成本降低，可大规模生产。还 可以生产一些原来只能靠提取得到的量极少不能作为药品的产品。还有可在食 用食品时就获得效果。缺点有：有些复杂的药品以现在的技术还无法使用基因工程合成，还有产品一 般为原材料，需进一步加工才能成为药品。
药效好，毒副作用小。药效好：基因工程药物是利用基因工程方法，将天然药物有效成分的基因进行定点突变，使药效提高或者延长药效，同时又避免副作用。毒副作用小：化学药物在合成过程中会有很多副产物，而基因工程药物在合成过程中不会有化学残留，因此毒副作用小。
优缺点：酯化反应如果用酰氯和醇反应活性较高，加碱就可以反应。但酰氯要从酸制备过来，稳定性不好且对设备有腐蚀。一是增加了扑热息痛的亲核性，便于与酰氯反应，再者这样产物为NaCl，不为盐酸也减少产品的分解。
由于地球生物的现实情况相当混沌，生物合成的产物难以期待纯度，往往是复杂的混合物，理化性质不容易完全把握、容易被意料之外的物质污染、不易纯化，分子量通常较大，作为药物难以通过血脑屏障之类且可能有抗原性。生物合成人胰岛素之类较为成熟的产品并不多见。
化学制药是化学药品的生产过程，由原料药生产和药物制剂生产两部分组成。原料药是药品生产的物质基础，但必须加工制成适合于服用的药物制剂，才成为药品。
一般化学药物纯度都比较高，所以不会引入一些细菌，病毒等微生物。 不会引入其他的有毒的化学成分。化学药物之所以能出售，都是经过临床试验的，所以肯定有效。正因为浓度上比较高，所以一般药效比较猛。
1、①药理活性强，给药剂量小，副作用少；②提取纯化工艺复杂，药物稳定差，分子结构中一般具有特殊的活性部位，以严格的空间构象维持其生物活性，在酸、碱环境或体内酶系统存在下极易降解失活；③体内快速清除，生物半衰期短；④分子量较大，很难透过胃肠道的上皮细胞层，故口服给药不易吸收。
2、生物农药概括起来主要具有以下几方面的优点：（1）选择性强，对人畜安全。目前市场开发并大范围应用成功的生物农药产品，它们只对病虫害有作用，一般对人、畜及各种有益生物（包括动物天敌、昆虫天敌、蜜蜂、传粉昆虫及鱼、虾等水生生物）比较安全，对非靶标生物的影响也比较小。（2）对生态环境影响小。
3、部分生物农药为活体生物，使用后可以自己繁殖，大大延长持效期，构建生态平衡的新环境。此外，生物农药来源广，改良潜力大，不容易产生抗药性，诸多方面的优点使得生物农药成为近年来发展的热点。缺点：与化学农药相比，也存在许多本身固有的弱点，比如起效慢、易受温湿度等条件影响、作用成分复杂等。
后生元利用的优缺点是如下：优点 安全性高：后生元经过灭菌处理，不含有活菌，因此安全性高，可以广泛应用于食品、药品等领域。功效明确：后生元作为生物活性物质，其功效相对明确，可以针对特定领域进行应用和研究。
体外药理研究则主要利用游离器官、培养的细胞或细胞器等来进行，其优点在于可以控制实验条件，减少生物个体差异的影响，同时也可以研究药物在生物体内的代谢和作用机制。此外，体外实验相对成本较低，且可以缩短实验时间。
低成本，可扩展性。在药物生产过程中能够按照人们所需要的特征设计重组DNA或者改造生物的特性，得到质量稳定的动植物及微生物产品，这种方法相较于传统药物生产过程投入成本更低。利用基因工程技术可获得新型化合物，扩大药物筛选来源。
缺点：学习压力大：中药资源与开发专业涉及的知识面广，学生需要掌握大量的理论知识和实践技能，学习压力相对较大。实践环节要求高：中药资源的种植、加工和研发需要大量的实地操作和实验，对学生的实践能力提出了较高的要求。
高效性：基因工程技术可以通过重组DNA技术，将目标基因插入到微生物或植物细胞中，使其产生特定的药物。相比传统药物生产方法，基因工程技术能够更高效地生产大量的药物，提高生产效率。精确性：基因工程技术可以精确地定制和调整药物的合成过程。
因此，在设计中往往是安眠安神类药品用蓝色，止痛镇静类药品用绿色，健胃消食类药品用橙色，保健滋补类药品用红色，轻松排便类药品用黄色。在医药产品包装设计中，要坚持因病制宜、因药效制宜、因消费者心理接受制宜、因时尚审美趣味制宜的原则，并重视创意。
优点易于溶解吸收，缺点是药物容易失效。空白制粒压片是将药物颗粒与流动剂混合后，通过压制成为片剂的制药工艺，空白颗粒直接压片的优点是药物颗粒均匀分布，溶解速度较快，易于吸收，可以提高药效。空白颗粒直接压片的缺点是药物压制过程中可能会受到压力和温度等因素的影响，导致药物的失效，从而影响药效。
缺点在于：QSAR方法不能明确给出回归方程的物理意义以及药物-受体间的作用模式，物理意义模糊是对QSAR方法最主要的置疑之一。另外在定量构效关系研究中大量使用了实验数据和统计分析方法，因而QSAR方法的预测能力很大程度上受到试验数据精度的限制，同时时常要面对“统计方法欺诈”的置疑。